libSBNW

Introduction

 libSBNW is a SBML compliant layout generation program.

Example:

//
//       #include "autolayoutc_api.h"
//
//       //...
//
//       // type to store layout info
//       gf_layoutInfo* l;
//
//
//       // load the model
//       gf_SBMLModel* mod = gf_loadSBMLbuf(buf);
// 
//
//       // options for layout algo
//       fr_options opt;
//
//
//       // read layout info from the model
//       l = gf_processLayout(mod);
//
//
//       // randomize node positions
//       gf_randomizeLayout(l);
//
//       // do layout algo
//       opt.k = 20.;
//       opt.boundary = 1;
//       opt.mag = 0;
//       opt.grav = 0.;
//       opt.baryx = opt.baryy = 500.;
//       opt.autobary = 1;
//       gf_doLayoutAlgorithm(opt, l);
//
//       // save layout information to new SBML file
//       gf_writeSBMLwithLayout(outfile, mod, l);
//
//
//       // run destructors on the model
//       gf_freeSBMLModel(mod);
//
//
//       // run destructors on the layout
//       gf_freeLayoutInfo(l);
//
// 

Installation

 Installation documentation is provided at https://github.com/0u812/sbnw.